Experience in organizing the remote collaboration of hydrobiologists and creating a database of digital images of plankton and benthos

Abstract

A database of digital images of common species of phytoplankton, zooplankton, phytobenthos and zoobenthos of the Black and Azov Seas is being created in the Laboratory of Hydrobiology of the Azov-Black Sea Branch of “VNIRO” (“AzNIIRKH”). No ecological databases focused on the species from the Black and Azov Seas, as well as from the freshwater bodies and streams of the Southern Russia are currently known to exist. International databases include some taxa of plankton and benthos inhabiting the Black and Azov Seas. Due to the territorial disunity of the researchers from the Azov-Black Sea Branch of “VNIRO” (“AzNIIRKH”), remote interaction was organized between those engaged in the processing of phytoplankton, zooplankton, zoobenthos and phytobenthos samples. The task of identifying species is one of the most challenging and timeconsuming in hydrobiological research; its solution requires from a specialist not only skills and a certain level of experience, but also continuous training in the relevant field of research. The creation of a database of digital photographic images will speed up the process of species determination and, prospectively, will allow automated processing of hydrobiological samples. A system of remote online consultations between the scientists, which applies the peer-to-peer networking technology, has been tested and is being actively implemented. Operational data exchange and online consultations make it possible to efficiently solve problems, as well as train young specialists via remote access.

В лаборатории гидробиологии Азово-Черноморского филиала «ВНИРО» («АзНИИРХ») создается база данных цифровых изображений массовых видов фитопланктона, зоопланктона, фитобентоса и зообентоса Черного и Азовского морей. Специализированные базы акватории Черного и Азовского морей, а также пресноводных водоемов и водотоков Юга России неизвестны. Отдельные таксоны планктона и бентоса, обитающие в Черном и Азовском морях, включены в международные базы данных. В связи с территориальной разобщенностью сотрудников Азово-Черноморского филиала «ВНИРО» («АзНИИРХ») организовано их дистанционное взаимодействие при обработке проб фитопланктона, зоопланктона, зообентоса и фитобентоса. Задача идентификации видов — одна из наиболее трудоемких в гидробиологических исследованиях; ее решение требует от специалиста не только наличия навыков и опыта работы определенного уровня, но и постоянного повышения квалификации по соответствующему направлению исследований. Создание базы данных цифровых фотоснимков позволит ускорить определение видовой принадлежности организмов, а в перспективе — перейти к автоматизированному процессу обработки гидробиологических проб. Апробирована и активно внедряется система дистанционной онлайн- консультации между сотрудниками с использованием технологии пиринговых сетей. Оперативный обмен данными и получение онлайн-консультаций позволяют эффективно решать поставленные задачи, а также дистанционно проводить обучение молодых специалистов.