Recherche par « RT-PCR » des virus enteriques chez des moules (<Mytilus galloprovincialis>) et des palourdes (<Ruditapes decussatus>)

Abstract

Dans cette étude comparative, deux méthodes d'extraction de quatre types de virus entériques pathogènes pour l’homme (virus de l’hépatite A, l’astrovirus, le norovirus et l’entérovirus) contaminant des moules (Mytilus galloprovincialis) et des palourdes (Ruditapes decussatus) ont été évaluées par l’application de la technique « Perverse Transcriptase- Polymerase Chain Reaction : RT-PCR ». Les échantillons des mollusques bivalves analysés ont été prélevés entre le mois de mars 2000 et le mois de septembre 2001 dans différents sites naturels de la lagune de Bizerte et sans subir l’étape de purification. Les résultats obtenus montrent que le taux de détection des virus par RT-PCR est meilleur lorsque les virus sont extraits à partir de l’estomac et de l’appareil digestif plutôt qu’à partir de la totalité de la chair des mollusques. Il en résulte également que 35% des échantillons analysés sont contaminés par au moins l’un des virus recherchés.

وردت ضمن هذه الدراسة مقارنة تقييميه لطريقتين لاستخلاص اربعة انواع من الفيروسات المعوية الممرضة للإنسان )فيروس الايباتيت- أ- ، الاستروفيروس، النوروولك فيروس و الانتيرو فيروس( و المحمولة في أنسجة بلح البحر و المحار و ذلك باستعمال تقنية تفاعلات أنزيم ألبلمرة المتسلسل. وقع جمع عينات الصدفيات الغير معالجة بين شهر مارس 2000 و شهر سبتمبر 2001 من مواقع طبيعية مختلفة من بحيرة بنزرت الكائنة بشمال تونس. من بين النتائج المتحصل عليها ضمن هذه الدراسة تبين لنا ان نسبة تشخيص الفيروسات باستعمال تقنية تفاعلات أنزيم ألبلمرة المتسلسل تكون افضل عندما يقع استخراج الفيروسات من المعدة ة و من الجهاز الهضمي للصدفيات علي نقيض استعمال النسيج بأكمله. من بين العينات المحللة تبين ان% 35 من الصدفيات تبدو ملوثة علي الاقل بأحد الفيروسات المعوية .

In this study, two extraction methods of four enteric viruses types (Hepatitis A virus, astrovirus, norovirus and enterovirus) known to be pathogenic for human beings were applied on mussels (Mytilus galloprovincialis) and clams (Ruditapes decussatus) and were comparatively evaluated by « Reverse Transcriptase- Polymerase Chain Reaction: RT-PCR ». Shellfish samples were collected between March 2000 and September 2001 in different natural sites of the Bizerta lagoon located in northern Tunisia and without undergoing the purification step. Results obtained here show that virus detection rate by RT-PCR is better when the viruses are extracted from stomach and digestive diverticula’s rather than from the entire shellfish flesh and also, that 35% of the analyzed samples are contaminated by at least one type of the virus searched for.